联盟秘书处为联盟的执行服务机构，负责联盟日常事务，在理事会闭会期间代为行使管理职能。秘书处实行秘书长负责制。在联盟单位超过三家的省市和地区，经当地联盟单位联合建议和联盟理事会同意，可以在当地设立秘书处分处，协助秘书处在当地范围内开展工作。
    联盟秘书处主要的工作职责如下：
1) 执行联盟理事会决议；
2) 执行联盟协议和各项管理制度；
3) 组织筹备联盟各类会议和活动；
4) 编制联盟规划、年度工作计划及财务预、决算报告，并向理事会做工作报告；
5) 负责年度经费预算的执行；
6) 负责联盟项目的协调和管理；
7) 负责联盟成员的管理，受理加入申请，对加入成员资格进行审定后报理事会审议批准；
8) 负责组织联盟的对外交流与合作；
9) 领导联盟秘书处下属各机构的工作；
10) 决定联盟秘书处下属各机构主要负责人；
11) 依据联盟有关管理制度，提议除名违规联盟成员及受理联盟成员退出联盟的申请；
12) 落实理事会交办的其他工作。
秘书处人员为：徐宏英、文彬、郭亚芬、张肖曼、庞辉、李耀敏。